每月9篇！上海基礎研究“刷屏”國際頂刊，發文量連續兩年增長30%
上海交通大學團隊領銜繪製全球首個海洋最深生態圖景，以封面專輯發表於《細胞》；復旦教授周鵬兩項突破性成果半個月內兩登《自然》；中國科學院分子植物科學卓越創新中心聯合瑞士洛桑大學，首次繪製出植物根系微生物“定居地圖”，登上《科學》封面……
2025年，上海科學家頂刊論文發文量再創新高：在《細胞》《自然》《科學》（CNS）三大國際頂尖期刊上發表論文181篇，同比增長14.6%，佔全國總數30.6%；其中以第一作者或通訊作者發表的頂刊論文109篇，較上年增長29.8%，這也是上海頂刊論文連續兩年實現約30%高增長，增幅位居全國城市前列。
頂刊論文數量是評估一個地區基礎研究質量的重要指標，高風險、高價值基礎研究則是頂刊論文的重要源頭。從“最薄芯片”到“最深海底”，一系列“從0到1”的突破背後，是上海用制度呵護勇敢的創新實踐——堅持大手筆“長線投資”，支持科學家開展高風險、高價值研究，給予長期穩定支持和容錯空間；同時推動基礎研究突破性成果與產業需求對接，加速“研值”變“產值”。
一年5篇頂刊封面，突破性成果頻現
曾經，論文登上頂刊封面是一年一遇的“稀罕事兒”。2025年，上海有5篇論文登上頂刊封面，從一個側面顯示出上海基礎研究的高水平與高價值。
基礎研究是一項高風險活動，具有不確定性、長期性等特徵。爲鼓勵科學家“十年幹一件事”勇闖“無人區”，上海在全國率先推出多項首創性探索，深化體制機制改革，營造寬鬆包容的科研環境。
作爲去年上海首篇頂刊封面論文的貢獻者，復旦大學附屬華山醫院神經內科主任醫師鬱金泰的另一個身份是“尚思”系列科學家。團隊的研究不是基於假說，而是基於來自真實世界的生物醫藥大數據。這種全新研究範式儘管價值巨大，卻“很難用傳統框架表述清楚”，常在申請項目時受到質疑。2024年，上海啓動運行上海尚思自然科學研究院，以戰略科學家爲主導，以選題爲核心，自主遴選高風險、高價值基礎研究項目，給予穩定支持——鬱金泰團隊在這裏遇到了“伯樂”。
去年4月，復旦大學周鵬教授團隊的全球首款二維半導體芯片“無極”、全球最快閃存“破曉”，半個月內連登《自然》。這樣的“快產出”源自“慢成長”——此前，周鵬已紮根上海30多年，讓他潛心科研的是上海“足夠包容”的氛圍與環境，“包容你做成事，也包容你‘不做事’，允許你沉下心積累。”僅僅8個月後，我國首條二維半導體工程化驗證示範工藝線在浦東川沙點亮。
近年來，上海基礎研究投入逐年增加，科研組織機制不斷優化。來自市科委的數據顯示，上海“十四五”期間全社會研發經費支出佔全市GDP生產總值比例約4.5%，基礎研究投入增長84.5%。2024年，上海科學家共承接國家自然科學基金項目5484項，獲批金額39.13億元；在滬全國重點實驗室實現14個領域全覆蓋，總數增至86家，上海“雙一流”建設高校達15所，均位居全國第二。
多學科交叉+多元投入，激活跨界創新
縱觀上海去年發表的頂刊論文，多學科交叉特徵明顯。在由上海科學家領銜的109篇論文中，生命科學佔比超60%，且大量突破來自化學、物理、信息科學等領域理論與方法的“跨學科支持”。
去年7月，由中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心牽頭，《細胞》雜誌首次以專輯形式，刊發來自中國腦科學領域的10項重磅成果。該專輯中，多篇論文的作者數量多達幾十人，涉及國內外相關科研機構30多個，騰訊AI實驗室、華大生命科學研究院等也參與了深度合作。
當前，科學研究正朝着多學科融合的方向快速演進。順應這一趨勢，上海已構建起基礎研究先行區“1+N”體系，由此搭建集高水平研究、人才集聚與培養爲一體的國際領先基礎科學與交叉學科研究平臺，爲解決複雜科學問題提供全方位視角與多元思路。
除了生命科學，上海在化學、物理、地球科學等領域也展現出一定的學科突破潛力，去年三個學科的頂刊發文量分別爲24篇、15篇、4篇，湧現出拓撲“水力鑷子”、全球首個全光大規模生成AI芯片、材料智能創制系統等一批對產業發展具有戰略意義的基礎研究成果。
爲促進科技創新與產業創新深度融合，上海在全國率先推出“探索者計劃”，引導企業出題，探索基礎研究多元投入機制。同時加強基礎研究佈局改革，通過設立長三角基礎研究聯合基金，支持優勢力量聯合開展產業目標導向明確的應用基礎研究，引領區域產業創新發展。
AI驅動加速跑，科學智能成新引擎
2023年61篇、2024年84篇、2025年109篇——上海科學家以第一作者或通訊作者發表的頂刊論文數量連續兩年增長約30%。如果將年度數據平均到每個月，上海基礎研究“加速跑”的態勢更爲直觀：2023年月均5.1篇，2024年7篇，2025年9.1篇。
這其中，科學智能（AI for Science）扮演着“推進器”——2025年，上海有近20篇頂刊論文將AI技術作爲核心工具，這一趨勢在生命科學、材料科學等領域尤爲顯著。
比如，上海交通大學副教授倪俊課題組在《細胞》發表論文，解決了50多年來多酶組裝無標準的難題。該研究開發了首個人工多酶複合體的理性設計工具——iMARS工具，推動多酶組裝從依賴實驗試錯邁向理性設計的新紀元。
上海人工智能實驗室聯合復旦大學等機構成功研發新一代裸眼3D顯示系統書生·瞳真，開啓光學信息運用全新範式——這一發表在《自然》上的成果，不僅爲全新的探索工具提供技術基礎，還可幫助大模型更精準地捕捉、理解和模擬現實世界中的複雜物理現象，推動科學智能大模型邁向與真實物理世界的全面融合。
這些研究廣泛運用機器學習、深度學習或大模型等前沿AI技術，針對複雜科學數據開展深入分析，助推多個學科科研範式變革，展現出科學智能在現代科研中的巨大潛力與價值。
市科委表示，“十五五”期間，將緊緊把握前沿科學極交叉融合的發展趨勢，推動AI賦能、數據驅動、跨界融合基礎研究新範式。
